1) [2+2] 付加環化反応、林雄二郎、奈良坂紘一、化学、44, 768-769 (1989).
 
2) キラルなルイス酸を用いる不斉反応、林雄二郎、奈良坂紘一、有機合成化学協会誌、48, 280-291 (1990).
 
3) メチレンシクロプロパノンアセタールを用いる[3+2]付加環化反応、林雄二郎、化学と工業、43, 2067-2068 (1990).
 
4) キラルなルイス酸触媒を用いる新しい不斉触媒反応の開発、林雄二郎、化学と工業、45, 259-263, (1992).
 
5) 有機金属化学を巧みに利用した天然物の全合成 Pd触媒を用いた(-)-ストリキニーネの全合成、林雄二郎、化学、59, 56-57 (2004).

6) 氷化高圧法を用いた合成反応の開発、林雄二郎、化学工業、55, 107-112 (2004).
 
7) 氷を反応場とする高圧有機合成の有用性、林雄二郎、化学と教育、52, 516-519 (2004).

8) 不斉有機触媒の最近の進歩、林雄二郎、有機合成化学協会誌、63, 464-477 (2005).

9) 有機触媒を用いたプロセス指向型不斉触媒反応、林 雄二郎、ケミカルエンジニアリング、51, 867-875 (2006).

10) Mitsuru Shoji, Yujiro Hayashi European Journal of Organic Chemistry, 23, 3783 (2007)

11) エポキシキノール類の全合成、庄司満、林雄二郎、有機合成化学協会誌、67, 102-113 (2009).

12) インフルエンザ治療薬オセルタミビルの3ポット合成 —ジフェニルプロリノールシリルエーテル触媒を用いた全合成—、石川勇人、林雄二郎、 化学と生物,48, 156 (2010).

13) Syntheses of Fumagillin and Ovalicin J. Yamaguchi, and Y. Hayashi Chem. Eur. J., ASAP

14)有機触媒を用いた(−)‐オセルタミビルの3ポット合成、石川勇人、林雄二郎、ファインケミカル, 39, 5 (2010).

15) ポットエコノミーを指向した効率的天然物合成、石川 勇人、林雄二郎 、ファインケミカル, 43, 2 (2014)

16) ここまでできる!短工程全合成、林雄二郎、佐藤格、化学、69, 64-65 (2014).

17) 有機触媒の医薬品合成への応用、林雄二郎、ファインケミカル、43, NO 6, 58-67(2014).